More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1925 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
358 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0807  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.77 
 
 
369 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1629  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 
368 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
362 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
356 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.16 
 
 
355 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  41.48 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
359 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  38.44 
 
 
364 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  42.09 
 
 
361 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 
374 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  41.18 
 
 
361 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
376 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
359 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
359 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.11 
 
 
377 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  39.44 
 
 
380 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 
356 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
362 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 
374 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 
382 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
362 aa  225  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  41 
 
 
362 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0977  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 
379 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 
367 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 
376 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.58 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  38.58 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.02 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  37.71 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 
373 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 
369 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.89 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.12 
 
 
355 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  38.61 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  40.5 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
368 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
364 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 
381 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
352 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 
359 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 
359 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 
363 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  37.87 
 
 
352 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 
359 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
352 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 
370 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.57 
 
 
363 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 
362 aa  202  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0196749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
361 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01580  ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 
355 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 
361 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  37.15 
 
 
368 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  35.25 
 
 
361 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 
365 aa  195  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 
363 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
357 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 
368 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 
361 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 
361 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  37.39 
 
 
360 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.41 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
358 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
367 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 
366 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.4 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1975  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 
352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.558913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 
367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
359 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1710  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
351 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
357 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2026  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 
369 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
352 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.06 
 
 
352 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
352 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
352 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
352 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
352 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
352 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
352 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.73 
 
 
351 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
352 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
352 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
352 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
352 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 
363 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4641  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 
379 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1256  molybdate transporter ATP-binding protein  35.49 
 
 
352 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>