More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1975 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1975  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 352 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.558913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3321  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  67.61 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1618  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  61.08 
 
 		 351 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  60.51 
 
 		 351 aa  434  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1457  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  61.24 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0473  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.39 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.39 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1710  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0415  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  54.99 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  54.99 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2960  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein modC  57.94 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0514  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  50.71 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2109  ABC-type molybdate transport system, ATPase component  46.15 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.24 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 		 355 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.72 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.76 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.17 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  35.9 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 		 361 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  34.01 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.82 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.06 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  34.01 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.76 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.11 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.18 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.32 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.6 
 
 		 372 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  34.62 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.76 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 		 382 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  36.34 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  36.34 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  36.34 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  35.17 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  36.34 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  32.47 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  38.16 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.88 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1256  molybdate transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  37.29 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  35.43 
 
 		 380 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02320  molybdenum import ATP-binding protein ModC  45.31 
 
 		 204 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  37.15 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  32.79 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.96 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  32.19 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  32.02 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.49 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  42.65 
 
 		 361 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.52 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  42.18 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.47 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.37 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>