More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2611 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1618  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  92.59 
 
 
351 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
351 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3321  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  71.23 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1457  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  64.29 
 
 
361 aa  447  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1975  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  60.51 
 
 
352 aa  434  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.558913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  61.54 
 
 
351 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0473  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 
351 aa  428  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0514  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  63.53 
 
 
351 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0415  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1710  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  57.59 
 
 
351 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2960  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein modC  63.19 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  59.03 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  53.3 
 
 
351 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2109  ABC-type molybdate transport system, ATPase component  50.43 
 
 
351 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 
361 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  37.15 
 
 
361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
361 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
361 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 
361 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 
367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  37.05 
 
 
361 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 
352 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 
362 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  36.69 
 
 
368 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 
368 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.64 
 
 
355 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
367 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 
363 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.92 
 
 
355 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  34.99 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.46 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  37.04 
 
 
352 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.05 
 
 
376 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  34.24 
 
 
366 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.59 
 
 
367 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 
365 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 
352 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
355 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.31 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
363 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  33.42 
 
 
368 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  32.6 
 
 
368 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 
369 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
358 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 
351 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
364 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  34.57 
 
 
352 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
364 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 
359 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 
358 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.26 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  35.04 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 
357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.8 
 
 
374 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  31.29 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 
359 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.83 
 
 
370 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.24 
 
 
364 aa  179  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
364 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  33.43 
 
 
380 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.81 
 
 
357 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 
365 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  33.24 
 
 
362 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
359 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
364 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.82 
 
 
362 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.68 
 
 
382 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 
362 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 
358 aa  175  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0338  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
221 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.475834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  32.79 
 
 
364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  34.29 
 
 
363 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0433  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.87 
 
 
221 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.58 
 
 
363 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
363 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
362 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 
355 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02320  molybdenum import ATP-binding protein ModC  44.44 
 
 
204 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.24 
 
 
356 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.94 
 
 
363 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
365 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  30.47 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  30.81 
 
 
385 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  30.84 
 
 
380 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  33.43 
 
 
361 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.79 
 
 
356 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  32.1 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  39.83 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.61 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>