More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0514 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0514  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
351 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2960  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein modC  78.2 
 
 
345 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1618  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  63.53 
 
 
351 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  63.53 
 
 
351 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3321  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  63.25 
 
 
351 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1457  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  63.66 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0473  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  56.13 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  58.29 
 
 
350 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  56.98 
 
 
351 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1975  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  56.53 
 
 
352 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.558913  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1710  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 
351 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0415  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  53.43 
 
 
351 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2109  ABC-type molybdate transport system, ATPase component  50 
 
 
351 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  52.57 
 
 
351 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.89 
 
 
355 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  39.39 
 
 
368 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 
368 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 
355 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 
365 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.06 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  33.43 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  38.42 
 
 
360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 
370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  33.06 
 
 
361 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
352 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  34.77 
 
 
352 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.06 
 
 
364 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 
361 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
361 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 
376 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 
363 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.63 
 
 
358 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 
362 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
359 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
359 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  33.24 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.81 
 
 
357 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.64 
 
 
364 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
361 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 
367 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 
362 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
367 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.48 
 
 
358 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 
357 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  36.16 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 
355 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 
377 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.34 
 
 
382 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  35.39 
 
 
361 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  35.29 
 
 
361 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.42 
 
 
356 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.13 
 
 
376 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  30.75 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.77 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  36.89 
 
 
363 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.71 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  30.52 
 
 
380 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 
356 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
359 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
354 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0196749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
364 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  31.34 
 
 
380 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 
365 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
363 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  32.4 
 
 
368 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  36.08 
 
 
362 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.12 
 
 
358 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  35.07 
 
 
364 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
366 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.6 
 
 
364 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  34.17 
 
 
357 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  35.31 
 
 
352 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.23 
 
 
359 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.28 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.4 
 
 
374 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.3 
 
 
364 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  33.24 
 
 
362 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0338  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
221 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.475834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 
352 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 
352 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>