More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2960 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2960  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein modC  100 
 
 
345 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0514  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  78.2 
 
 
351 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3321  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
351 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1618  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
351 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
351 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1457  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  62.07 
 
 
361 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  58.02 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1710  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  58.19 
 
 
351 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0473  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.43 
 
 
351 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1975  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.94 
 
 
352 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.558913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.6 
 
 
350 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0415  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  55.85 
 
 
351 aa  388  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2109  ABC-type molybdate transport system, ATPase component  51.45 
 
 
351 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  53.22 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  34.37 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  37.75 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 
361 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 
361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 
370 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
355 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.81 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
365 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  34.37 
 
 
361 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
359 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
359 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
352 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 
352 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.62 
 
 
358 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 
359 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.72 
 
 
362 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 
361 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 
361 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.75 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  33.7 
 
 
361 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
355 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.15 
 
 
367 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 
364 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 
367 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
361 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 
363 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 
367 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.57 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.68 
 
 
351 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  35.57 
 
 
360 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.87 
 
 
356 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  34 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 
364 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  35.45 
 
 
380 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
356 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 
377 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
366 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
364 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.9 
 
 
374 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  30.29 
 
 
380 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.54 
 
 
373 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  31.88 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.1 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  30 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
369 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
352 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.43 
 
 
374 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.1 
 
 
355 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
352 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
352 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  33.81 
 
 
361 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
352 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
352 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
352 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
352 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 
365 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  33.52 
 
 
361 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 
363 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  37 
 
 
380 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  35.98 
 
 
362 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  34.49 
 
 
352 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  34.49 
 
 
352 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 
381 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  34.49 
 
 
352 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 
352 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  42.57 
 
 
363 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
352 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  39.38 
 
 
301 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
358 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 
352 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
376 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  45.31 
 
 
376 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 
363 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  29.05 
 
 
385 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>