More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0708 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 381 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  75.07 
 
 		 377 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  76.28 
 
 		 376 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  74.66 
 
 		 373 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  62.18 
 
 		 365 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  57.98 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  52.33 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  49.44 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 		 363 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.68 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  48.63 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  50.14 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  48.35 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.86 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  48.08 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  47.5 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.62 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0977  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.94 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2026  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  46.93 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 		 368 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01580  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 358 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  40.71 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 		 357 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  39.89 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  43.43 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 359 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 352 aa  229  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1581  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 		 254 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 		 361 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  37.11 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.57 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  38.42 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.34 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 364 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  44.38 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1629  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.9 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0807  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.76 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>