More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1011 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  89.18 
 
 		 367 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  77.22 
 
 		 356 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  77.98 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  62.87 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  60.18 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  61.08 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  60.18 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  57.68 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  58.63 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  57.97 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  58.21 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  55.36 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  56.68 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  58.66 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  52.34 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  56.42 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  50.96 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  52.07 
 
 		 374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.63 
 
 		 423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.63 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.55 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  51.95 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 327 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.65 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  41.83 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  49.39 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.5 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.12 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  46.92 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.42 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.8 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  48.54 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  50 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  41.06 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  41.06 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  49.8 
 
 		 374 aa  252  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  41.92 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.73 
 
 		 447 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.22 
 
 		 361 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  41.06 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.81 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.6 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.22 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  43.07 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2127  ABC transporter related  45.35 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0500595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  39.83 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  50.37 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  50.83 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  47.51 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  43.29 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.54 
 
 		 399 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  52.52 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  52.52 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  52.52 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.6 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.33 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  42.05 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  42.05 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  50.6 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  52.77 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.66 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  41.16 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  43.6 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 		 374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.6 
 
 		 371 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.6 
 
 		 371 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 348 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  41.76 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>