More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2894 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 440 aa  896    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  62.93 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  61.21 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  60.24 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  61.21 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  62.42 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  61.28 
 
 		 331 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  59.47 
 
 		 367 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  55.28 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  60.06 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  61.3 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  60.44 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  60.99 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  59.01 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  53.56 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  54.44 
 
 		 363 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  62.23 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  59.33 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  56.93 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  56.85 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 368 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 		 343 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.25 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  50.35 
 
 		 343 aa  276  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  45.43 
 
 		 337 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.89 
 
 		 356 aa  276  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.23 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 337 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  45.12 
 
 		 337 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 337 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  45.12 
 
 		 337 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 337 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.17 
 
 		 346 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.21 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.05 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  41.62 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.73 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 		 327 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  40.48 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 		 327 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.15 
 
 		 352 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.39 
 
 		 356 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 327 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 331 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 331 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.49 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 327 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 327 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 		 352 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.83 
 
 		 338 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3621  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.98 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.247343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.94 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  41.76 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  41.76 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  41.76 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.52 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.99 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.88 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.17 
 
 		 360 aa  260  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  52.08 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  44.55 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  41.76 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  50.39 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.72 
 
 		 370 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  49.37 
 
 		 352 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 		 337 aa  259  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 349 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.12 
 
 		 373 aa  259  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  51.05 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.31 
 
 		 365 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.3 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.03 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  52.72 
 
 		 349 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.88 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  51.05 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.63 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.41 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  46.38 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.62 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  43.33 
 
 		 350 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  44.97 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.22 
 
 		 348 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  51.05 
 
 		 353 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.11 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>