More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3942 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  100 
 
 		 331 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  78.85 
 
 		 329 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  78.55 
 
 		 329 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  59.76 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  62.16 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  61.86 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  60.18 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  56.7 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  55.84 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  59.27 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  55.27 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  60.31 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  58.6 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  58.91 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  58.48 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  60.31 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  57.51 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  56.94 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  58.91 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.71 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  42.82 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.06 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  43.94 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.66 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.31 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 		 356 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.38 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  54.01 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  54.69 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  51.48 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.27 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  49.64 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  54.2 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.07 
 
 		 377 aa  255  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  49.65 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.72 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.31 
 
 		 447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  53.62 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.14 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  46.98 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  41.04 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  46.33 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.44 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.52 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  53.53 
 
 		 384 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  44.67 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  45.75 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  45.75 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.91 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  51.02 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  50 
 
 		 377 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  45.39 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  45.39 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.59 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  49.62 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.63 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  44.13 
 
 		 352 aa  248  8e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  50.57 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.32 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.63 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.12 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.95 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.02 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.16 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.96 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.08 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.06 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  43.56 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 384 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  51.05 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 367 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.05 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.12 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  43.42 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.17 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>