More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2473 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  78.24 
 
 
367 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  77.22 
 
 
358 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  74.93 
 
 
372 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  63.36 
 
 
331 aa  411  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  61.86 
 
 
331 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  62.16 
 
 
329 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  58.62 
 
 
352 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  61.56 
 
 
329 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.93 
 
 
440 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  57.46 
 
 
352 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  55.49 
 
 
351 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  60.62 
 
 
333 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  58.11 
 
 
357 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  58.08 
 
 
325 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  57.78 
 
 
325 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  51.76 
 
 
374 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  58.56 
 
 
325 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  52.23 
 
 
363 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  51.52 
 
 
363 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 
368 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.02 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 
387 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 
372 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.91 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 
327 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
327 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.99 
 
 
343 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50 
 
 
426 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
327 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
327 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
327 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
327 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 
331 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 
327 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.43 
 
 
372 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  50.83 
 
 
371 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.59 
 
 
378 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.59 
 
 
378 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.44 
 
 
369 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.59 
 
 
378 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.63 
 
 
377 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.59 
 
 
378 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.59 
 
 
378 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.36 
 
 
373 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 
363 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
340 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  55.08 
 
 
349 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  51.11 
 
 
377 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.58 
 
 
343 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  54.92 
 
 
361 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  51.88 
 
 
374 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
342 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.37 
 
 
382 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  47.75 
 
 
367 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.8 
 
 
354 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.41 
 
 
371 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.12 
 
 
346 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.08 
 
 
363 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.19 
 
 
371 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 
343 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.78 
 
 
384 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  51.58 
 
 
356 aa  256  5e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
333 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  43.06 
 
 
408 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
345 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  48.33 
 
 
352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.75 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3522  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.25 
 
 
384 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.8 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.09 
 
 
383 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  51.88 
 
 
378 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.88 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.88 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.21 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.84 
 
 
423 aa  252  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 
337 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  40.75 
 
 
337 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.69 
 
 
374 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 
337 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.21 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  40.75 
 
 
337 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  40.75 
 
 
337 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 
337 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.07 
 
 
354 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
358 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 
337 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.04 
 
 
366 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  40.75 
 
 
337 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>