11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2853 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2853  putative signal peptide  100 
 
 		 161 aa  317  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  38.26 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  33.61 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  33.61 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  29.51 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  35.19 
 
 		 234 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  32.77 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3908  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4251  hypothetical protein  33.7 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00586984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2723  hypothetical protein  27.71 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>