63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2800 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  40 
 
 		 182 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  40.19 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  42 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  40 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  36.13 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  37.04 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30.65 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  31.31 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  37.76 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  35.2 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  39.8 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  27.4 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  34.69 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.58 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  34.92 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  30.09 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  35.19 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  30.09 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  34.69 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  36.27 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  35.71 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  32.99 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  33.68 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  34.02 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  30.09 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  32.99 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  33.66 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  37.61 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  31 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  31.45 
 
 		 1291 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 178 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  35.92 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  28.93 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  29.85 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.25 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  24.3 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  27.19 
 
 		 440 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.69 
 
 		 125 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.68 
 
 		 154 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  29.9 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.22 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.58 
 
 		 154 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  27.82 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  33.94 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.22 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2142  restriction endonuclease  23.2 
 
 		 547 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.21 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  30.3 
 
 		 1004 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.38 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.38 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  30.3 
 
 		 196 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0356  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  42.4  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000881687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  28.39 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>