56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1446 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  100 
 
 		 328 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  33.11 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.2 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  37.04 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  40.22 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.04 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  32.79 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.46 
 
 		 421 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  32.61 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.53 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  31.11 
 
 		 171 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  25.68 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 184 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  28.89 
 
 		 520 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  26.27 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  28.97 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  31.08 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  31.78 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  29.89 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  29.57 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  25.52 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  25.52 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  26.55 
 
 		 585 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 201 aa  46.2  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  31.34 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  26.88 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  31.07 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  25.96 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  25.86 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  26.79 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.09 
 
 		 154 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30.1 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  26.73 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  34.02 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.09 
 
 		 154 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.37 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.67 
 
 		 493 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  26.79 
 
 		 182 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  26.37 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.09 
 
 		 125 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>