24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2379 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30.91 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  31.25 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  27.4 
 
 		 400 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  27.57 
 
 		 306 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.25 
 
 		 349 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  28.57 
 
 		 306 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  29.66 
 
 		 403 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 328 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.26 
 
 		 359 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.97 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.88 
 
 		 345 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  34.52 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  31.52 
 
 		 493 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.78 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  26.52 
 
 		 386 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  30.3 
 
 		 313 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 326 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.25 
 
 		 333 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  32.58 
 
 		 363 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>