99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0042 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  100 
 
 		 326 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  33.11 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.13 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  35.83 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  32.77 
 
 		 125 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  26.2 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.45 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  31.01 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.68 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  35.78 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  34.09 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  31.45 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  30.11 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  31.15 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  29.13 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  29.31 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  25 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  28.83 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  30.28 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.31 
 
 		 493 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  29.09 
 
 		 182 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  29.6 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  29.09 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  29.51 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  25.89 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.77 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  28.8 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  27.56 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  26.55 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  23.73 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  25.62 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  33.33 
 
 		 447 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  27.35 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  28.23 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  28.18 
 
 		 182 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  24.55 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  25.62 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  24.55 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  27.43 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  31.36 
 
 		 440 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  27.05 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  26.23 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  31.67 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  23.73 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  27.74 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30.56 
 
 		 171 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  28.81 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.96 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  26.96 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  26.95 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  32.86 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  27.94 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  27.94 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  27.94 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  27.68 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  26.96 
 
 		 200 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 201 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  25 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  24.18 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  27.64 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  27.83 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  27.35 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  27.35 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  23.97 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  30 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  26.42 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 520 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  26.42 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  24.17 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  24.11 
 
 		 187 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  27.78 
 
 		 196 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  28.26 
 
 		 1131 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  28.26 
 
 		 1004 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  30.11 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>