78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2859 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  100 
 
 		 374 aa  765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  35.82 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  31.76 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  28.08 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  38.78 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.43 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  40.22 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.2 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  29.27 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  29.27 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  30.91 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  29.27 
 
 		 154 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.91 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.96 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.23 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35.4 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  29.01 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  36.14 
 
 		 664 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.45 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  35.11 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.75 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  31.93 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  27.86 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  35.11 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.26 
 
 		 306 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  33.67 
 
 		 182 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  33.93 
 
 		 305 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.7 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  32.63 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.7 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  27.82 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  26.02 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  28.23 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.05 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  31.19 
 
 		 171 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  31.15 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  31.63 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.94 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.95 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  29.59 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  26.17 
 
 		 302 aa  46.2  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 303 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2132  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1430 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 799 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  29.84 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  27.62 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  31 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  31 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 799 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  30 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  20.86 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  25.6 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  31.78 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30 
 
 		 450 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  30.85 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  27.13 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.69 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  25.95 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.69 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2254  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1442 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>