94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1542 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  35.56 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  35.56 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  35.56 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  34.81 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  42.42 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  29.5 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.82 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  32.52 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  35.63 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.88 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  33.6 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  33.33 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.34 
 
 		 349 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  26.04 
 
 		 403 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  32.2 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.04 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  32.54 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  29.92 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  30.83 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 293 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  27.06 
 
 		 374 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 493 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  35.96 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 302 aa  52.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  33.65 
 
 		 303 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.86 
 
 		 345 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  32.69 
 
 		 304 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 310 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.4 
 
 		 252 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 328 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  29.75 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 310 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  26.15 
 
 		 359 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  33.65 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  29.75 
 
 		 400 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  34.12 
 
 		 585 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  34.07 
 
 		 306 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  25.78 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  30.16 
 
 		 302 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.89 
 
 		 306 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  27.34 
 
 		 333 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  35.23 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  34 
 
 		 302 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.25 
 
 		 355 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.46 
 
 		 296 aa  47.8  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  31.31 
 
 		 297 aa  47.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  38.2 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  26.57 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  38.96 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.91 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  29.51 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  24.39 
 
 		 323 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  30.38 
 
 		 664 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  32.97 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  24.39 
 
 		 323 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  37.04 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  32.1 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 345 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  27.97 
 
 		 304 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  27.97 
 
 		 304 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  27.97 
 
 		 304 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  30.1 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.01 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  32.32 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  27.84 
 
 		 328 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  28.06 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  22.96 
 
 		 320 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  31.43 
 
 		 364 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  41.43 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  23.68 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  28.23 
 
 		 447 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.94 
 
 		 333 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  27.62 
 
 		 421 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 346 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  23.17 
 
 		 314 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 454 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  28.78 
 
 		 307 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  32.58 
 
 		 291 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  32.58 
 
 		 291 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  23.73 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  23.01 
 
 		 363 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0367  restriction endonuclease  30.59 
 
 		 385 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 799 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0360  restriction endonuclease  30.59 
 
 		 385 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  22.94 
 
 		 342 aa  40.8  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 799 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>