115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0154 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  38.89 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  34.95 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  31.67 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  34.07 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  34.83 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  33.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  32.2 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  29.13 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  29.13 
 
 		 182 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  38.78 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  38.3 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.02 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  33.33 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.63 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  32.76 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  33.63 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  33.63 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  35.78 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.22 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  35.45 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  33.59 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.33 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  28.28 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  36.14 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.81 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  31.91 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  29.76 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  40.82 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  31.91 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  31.43 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  27.97 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  34.35 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  31.73 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  36.84 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  34.65 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  35.96 
 
 		 128 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  28.74 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.68 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  39.18 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  29.91 
 
 		 207 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  33.02 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  31.75 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  29.61 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  29.27 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  31.33 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  26.92 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  26.92 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  27.52 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  38.54 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.25 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  35.11 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  27.62 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  33.59 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  30.65 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 233 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 233 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  24.3 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  27.45 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  34.38 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  32.5 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  26.88 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  25.95 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  23.38 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  25.2 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 799 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 799 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  25.62 
 
 		 1248 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  31.86 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  27.06 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.56 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  25.35 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  25.35 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.86 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  36.08 
 
 		 374 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  34.74 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  34.74 
 
 		 440 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  32.29 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  21.81 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  23.74 
 
 		 493 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>