58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1406 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  100 
 
 		 328 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  37.95 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  37.05 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  39.4 
 
 		 342 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  37.35 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  40.07 
 
 		 271 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  31.36 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.23 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  26.44 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  26.32 
 
 		 346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  28.08 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  25.22 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  36.62 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.1 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.25 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.25 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.25 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.25 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.91 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.76 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  31.88 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  25.66 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  33.04 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  34.62 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  33.04 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  28.8 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  27.5 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  27.81 
 
 		 161 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  26.5 
 
 		 805 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  26.67 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  31.37 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  26.67 
 
 		 421 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  32.77 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  27.73 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 493 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  30.77 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  25.16 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  25.86 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  26.22 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  26.02 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  26.89 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  23.85 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  26.21 
 
 		 1131 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  36 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  27.84 
 
 		 184 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  30.53 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  24.85 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  33.68 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.53 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>