120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3754 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  100 
 
 		 805 aa  1665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  53.12 
 
 		 459 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.47 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  53.12 
 
 		 459 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.53 
 
 		 421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.04 
 
 		 732 aa  281  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  43.97 
 
 		 609 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  43.97 
 
 		 609 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  44.69 
 
 		 781 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  43.43 
 
 		 810 aa  239  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  44.1 
 
 		 734 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  45.54 
 
 		 655 aa  198  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  39.02 
 
 		 678 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  41.58 
 
 		 539 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.06 
 
 		 822 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.38 
 
 		 502 aa  174  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.83 
 
 		 743 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  40.44 
 
 		 743 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.6 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.27 
 
 		 683 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.06 
 
 		 754 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  32.06 
 
 		 705 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  41.29 
 
 		 629 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  34.98 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.83 
 
 		 685 aa  161  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  38.38 
 
 		 853 aa  160  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  38.27 
 
 		 741 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.46 
 
 		 568 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.35 
 
 		 626 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.79 
 
 		 698 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  36.68 
 
 		 587 aa  157  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  36.86 
 
 		 899 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  39.42 
 
 		 685 aa  154  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  40.41 
 
 		 691 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.64 
 
 		 765 aa  140  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  33.21 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.58 
 
 		 590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  39.22 
 
 		 498 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  39.22 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.46 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 585 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.27 
 
 		 530 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.18 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  32.72 
 
 		 999 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  30.88 
 
 		 303 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.67 
 
 		 603 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  34.59 
 
 		 851 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  37.1 
 
 		 845 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  32.72 
 
 		 450 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.21 
 
 		 398 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.89 
 
 		 605 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  29.7 
 
 		 666 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  35.05 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  37.89 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.11 
 
 		 723 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  38.07 
 
 		 862 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  37.91 
 
 		 900 aa  108  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.75 
 
 		 696 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  41.49 
 
 		 722 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  41.56 
 
 		 598 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  40.43 
 
 		 834 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  35.08 
 
 		 571 aa  104  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  37.14 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.17 
 
 		 603 aa  93.2  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  31.89 
 
 		 412 aa  92  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 		 795 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  27.07 
 
 		 597 aa  87.4  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.2 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  31.77 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.25 
 
 		 530 aa  77.4  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.18 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  26.67 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.8 
 
 		 651 aa  72  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.84 
 
 		 748 aa  70.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  25.35 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  24.44 
 
 		 513 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  30.77 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  32.92 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  24.49 
 
 		 352 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  23.87 
 
 		 524 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.41 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  22.38 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  25.19 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  23.74 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  23.74 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.55 
 
 		 606 aa  55.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  27.89 
 
 		 589 aa  55.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 341 aa  55.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.98 
 
 		 559 aa  54.7  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  24.72 
 
 		 847 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  24.72 
 
 		 843 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  28.5 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  28.99 
 
 		 474 aa  53.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.4 
 
 		 559 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30 
 
 		 333 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.86 
 
 		 542 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  24.73 
 
 		 578 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  27.83 
 
 		 351 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  24.16 
 
 		 844 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.81 
 
 		 568 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>