55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11011 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  70.34 
 
 
289 aa  220  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  70.34 
 
 
289 aa  219  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  43.27 
 
 
247 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  42.31 
 
 
249 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  38.39 
 
 
260 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  38.39 
 
 
260 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  39.29 
 
 
249 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  40.38 
 
 
260 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  32.58 
 
 
233 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  32.58 
 
 
233 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  35.25 
 
 
233 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  33.33 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  36.21 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  34.29 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  41.05 
 
 
520 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  36.84 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  34.65 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  34.65 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  31.63 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  35.79 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  40 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  33.66 
 
 
200 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.86 
 
 
359 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.68 
 
 
313 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  36.14 
 
 
305 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.58 
 
 
368 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  29.7 
 
 
421 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  35.56 
 
 
342 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  30 
 
 
364 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.48 
 
 
333 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.06 
 
 
349 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  30.28 
 
 
1291 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  32.67 
 
 
328 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  32.22 
 
 
271 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  30.77 
 
 
328 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.87 
 
 
363 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  32.91 
 
 
330 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30.56 
 
 
326 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  31 
 
 
440 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  24.55 
 
 
291 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  26 
 
 
346 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.52 
 
 
493 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  31 
 
 
327 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  30.36 
 
 
306 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  28.57 
 
 
297 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  24.6 
 
 
386 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  27.03 
 
 
1248 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  26.72 
 
 
285 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  25 
 
 
345 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  26.47 
 
 
271 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  24.24 
 
 
317 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  28.1 
 
 
450 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.47 
 
 
252 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  24.69 
 
 
351 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>