46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11061 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  577  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  92.99 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  70.34 
 
 		 145 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  42.31 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  42.31 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  40 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  40.38 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  40.38 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  40 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  40.95 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11001  hypothetical protein  56.06 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  38.61 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  38.61 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  42.11 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  38.14 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  33.94 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  37.04 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  36.63 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  29.91 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  34.69 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  36.96 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.91 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  27.93 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  30.11 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.73 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  24.47 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  28.07 
 
 		 1004 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  26.52 
 
 		 799 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  26.52 
 
 		 799 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  29.9 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.9 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  27.56 
 
 		 1291 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  32.69 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  27.43 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  32.32 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  27.03 
 
 		 1248 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  32.61 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>