77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4576 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  45.14 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  44.44 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  45.04 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  44.44 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  41.73 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  38.76 
 
 		 200 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  32.62 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  36.04 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  39.58 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  32.14 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  38.61 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.67 
 
 		 305 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 359 aa  71.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  43.33 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.94 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  38.95 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  35.42 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.44 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  35.42 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  37.89 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  27.85 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  27.42 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.99 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  35.79 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  31.31 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  24.07 
 
 		 252 aa  62  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  28.77 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  36.46 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2613  hypothetical protein  26.95 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.81 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  28.81 
 
 		 355 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1308  hypothetical protein  28.16 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  31.68 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  29.73 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  29.73 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  35.42 
 
 		 249 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30 
 
 		 349 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  29.73 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 313 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  29.73 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  26.85 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  29.31 
 
 		 310 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  27.03 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.68 
 
 		 296 aa  49.3  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 1248 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  31.3 
 
 		 1291 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  28.7 
 
 		 440 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  29.14 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.91 
 
 		 346 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  28.97 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.91 
 
 		 454 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.33 
 
 		 585 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  28.28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  35.42 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  28 
 
 		 453 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  27 
 
 		 455 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  27.64 
 
 		 454 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  27.64 
 
 		 454 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 328 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  27.72 
 
 		 454 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  33.71 
 
 		 305 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  25.69 
 
 		 192 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  36.26 
 
 		 305 aa  42  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  25 
 
 		 326 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  27.12 
 
 		 403 aa  41.2  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>