64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0711 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  36.84 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  34.81 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  48.72 
 
 		 200 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  34.9 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  43.33 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  37.3 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  40.68 
 
 		 520 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  41.18 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  39.66 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  41.03 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  35.04 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  35.88 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  33.33 
 
 		 355 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35.48 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  35.25 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 1291 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  36.72 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  39.45 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  38.84 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  31.11 
 
 		 1131 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  38.02 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  34.51 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  35.34 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  29.92 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  32.62 
 
 		 310 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  32.04 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  34.95 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.63 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  35.26 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  26.45 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  26.45 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  26.45 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  26.67 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  31.07 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  33.06 
 
 		 281 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 		 421 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 313 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.56 
 
 		 305 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 454 aa  47.4  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 453 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  29.09 
 
 		 348 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  31.07 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  31.78 
 
 		 320 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  36.94 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.07 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 454 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  30.28 
 
 		 455 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  35 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  29.55 
 
 		 1149 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.69 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 201 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0870  hypothetical protein  26.74 
 
 		 263 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323325  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.6 
 
 		 454 aa  41.2  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5134  restriction endonuclease  37.31 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360848  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.79 
 
 		 345 aa  40.8  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 498 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>