77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4809 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  50 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  39.7 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  46.88 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  40.14 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  36.22 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  39.13 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  43.69 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5134  restriction endonuclease  35.33 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360848  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  38.64 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  41.07 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  40.91 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  32.14 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  41.12 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  30.71 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  39.29 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  40.32 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  34.75 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3506  restriction endonuclease  30.49 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  39.06 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.33 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.97 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  39.5 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  38.61 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  38.46 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  42.06 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  30.84 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  32.76 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  40.62 
 
 		 558 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  37.5 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  32.7 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  34.48 
 
 		 403 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  32.03 
 
 		 1131 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 450 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  40 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 799 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 799 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 498 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  36.11 
 
 		 305 aa  48.9  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 305 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  36.59 
 
 		 364 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  42.86 
 
 		 307 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 374 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.75 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.73 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  28.93 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  30.16 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  38.68 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  38.04 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  34.96 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.37 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  31.43 
 
 		 454 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  37 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  35.88 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 454 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  38.71 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  31.13 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  38.71 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 454 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  40.48 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  33.85 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  29.37 
 
 		 301 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  33.63 
 
 		 304 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  36.17 
 
 		 585 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  31.43 
 
 		 454 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  37.27 
 
 		 286 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5185  restriction endonuclease  32.58 
 
 		 304 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 455 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>