50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3127 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  88.64 
 
 		 454 aa  790    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  91.41 
 
 		 454 aa  838    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  79.3 
 
 		 454 aa  768    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  100 
 
 		 454 aa  932    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  65.16 
 
 		 453 aa  592  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  60.96 
 
 		 455 aa  554  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  30.89 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.03 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  30.6 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  31.54 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  26.77 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 289 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  35 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  35 
 
 		 154 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  36.61 
 
 		 154 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  34.17 
 
 		 125 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.4 
 
 		 493 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 302 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  27.91 
 
 		 349 aa  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.95 
 
 		 285 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  36.19 
 
 		 200 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 799 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 799 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 304 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  30.7 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  29.52 
 
 		 207 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.33 
 
 		 291 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.54 
 
 		 306 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  31.43 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  33.66 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  31.47 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  29.1 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  25 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  25.58 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1903  restriction endonuclease  27.97 
 
 		 640 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  hitchhiker  0.0000000420934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30.21 
 
 		 310 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  27.64 
 
 		 169 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  29.7 
 
 		 171 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  27.22 
 
 		 291 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  27.22 
 
 		 291 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  30.23 
 
 		 305 aa  43.5  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>