78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0888 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  57.47 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  56.82 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  57.28 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  56.29 
 
 		 302 aa  351  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  52.48 
 
 		 304 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  53.27 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  52.77 
 
 		 303 aa  315  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  49.34 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  53.11 
 
 		 305 aa  311  6.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  52.92 
 
 		 302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  49.01 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  48 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  45.63 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  43.56 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  43.32 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  39.41 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  41.1 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  44.77 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  44.77 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  41.29 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  41.1 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  37.13 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  36.16 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  38.44 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  41.03 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  40.72 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  40.72 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  36.69 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  38.76 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  51.72 
 
 		 128 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  30.69 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  29.18 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  30.69 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.15 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  28.28 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  28.62 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  28.15 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  28.1 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  26.21 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  36 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.34 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  23.05 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  36.36 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  36.36 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  36.36 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  36.36 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.53 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  33.33 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  33.33 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  25.09 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  30.72 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  31.45 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.55 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.16 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.13 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  33.7 
 
 		 184 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  41.25 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  41.25 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  38.89 
 
 		 70 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  26.85 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  29.92 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.5 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  29.1 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 585 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.44 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.44 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  29.1 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  29.92 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  31.58 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  29.36 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  27.83 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  28.46 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>