115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4287 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  100 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  48.79 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  49.82 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  49.28 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  48.56 
 
 		 454 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  43.45 
 
 		 288 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  42.48 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  42.48 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  33.21 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  32.65 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.61 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  32.41 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  29.59 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  28.25 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  28.67 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  27.21 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  31.14 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.46 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.96 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  29.12 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  29.77 
 
 		 304 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  26.64 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  26.32 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  39.01 
 
 		 493 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  27.96 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  27.69 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  27.96 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  43.75 
 
 		 349 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  36.81 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  26.46 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.6 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  29.32 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  28.14 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  42.75 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  27.74 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  28.48 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  38.4 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  28.16 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  27.92 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  27.92 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  22.64 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  36.52 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  36.07 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.67 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  43 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  39.06 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  29.23 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  31.82 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  36.59 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  34.48 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  34.71 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  35.38 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  36.64 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.46 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  37.38 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.57 
 
 		 493 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 585 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 799 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 799 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  30.83 
 
 		 187 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  23.64 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  31.5 
 
 		 440 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  34.85 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  28.33 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  25.62 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  29.06 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  28.57 
 
 		 447 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  33.87 
 
 		 182 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.83 
 
 		 154 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.83 
 
 		 154 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.58 
 
 		 125 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.83 
 
 		 154 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  29.78 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  32.82 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  29.33 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  35.65 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  32.17 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  36.61 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  29.33 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  29.09 
 
 		 128 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  32.26 
 
 		 182 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  28.33 
 
 		 196 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>