29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9871 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  50.6 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  53.42 
 
 		 208 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  52.74 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  36.78 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  24.86 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  24.86 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  24.86 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  28.45 
 
 		 125 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  27.27 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.68 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 271 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  27.56 
 
 		 386 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 302 aa  45.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.46 
 
 		 285 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.91 
 
 		 355 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  27.41 
 
 		 305 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  31.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  31.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  24.11 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  31.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.89 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29 
 
 		 289 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  30.66 
 
 		 311 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  26.14 
 
 		 799 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  26.14 
 
 		 799 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>