71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1502 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  100 
 
 		 307 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  41.04 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  38.49 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  39.16 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  40.48 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  40.13 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  38.24 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  38.22 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  37.9 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  40.2 
 
 		 304 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  39.74 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  40.2 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  39.16 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  40.52 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  38.44 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  40.2 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  32.04 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  39.14 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  36.81 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  36.48 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  36.16 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  33.99 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  37.01 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  37.01 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.82 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.82 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.82 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  36.91 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  37.62 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.94 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.56 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  43.33 
 
 		 128 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  27.81 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  27.01 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  26.86 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  26.97 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  24.26 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  26.2 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  23.93 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  33.59 
 
 		 493 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  36.84 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  34.19 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  28.19 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.68 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  34.19 
 
 		 125 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  40.4 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  25.41 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  34.19 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  31.58 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  34.19 
 
 		 154 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.84 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  39.25 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  27.82 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 493 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  35.79 
 
 		 440 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  31.46 
 
 		 609 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  31.46 
 
 		 609 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  35.79 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  42.86 
 
 		 219 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  32.97 
 
 		 498 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  29.57 
 
 		 421 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  27.05 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  34.48 
 
 		 364 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>