105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4933 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  100 
 
 		 304 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  77.63 
 
 		 304 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  77.63 
 
 		 304 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  77.3 
 
 		 304 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  57 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  40.07 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  40.13 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  37.13 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  37.86 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  36.45 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  38.19 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  35.35 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  35.03 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  36.27 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  38.06 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  35.39 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  37.46 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  35.5 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  38.06 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  36.3 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  37.62 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  34.84 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.8 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  33.33 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  34.59 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.27 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.29 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  36.16 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  36.16 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  31.05 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  25.08 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  46.85 
 
 		 128 aa  102  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  27.63 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.55 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  28.48 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  27.81 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  25 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  27.7 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  24.84 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  24.84 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  24.84 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  27.56 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.85 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.88 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.88 
 
 		 154 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.88 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  31.45 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.66 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  33.54 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  32.9 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  32.68 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.93 
 
 		 585 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  32.68 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  32.24 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  24.52 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.14 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  33.55 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  36.36 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  36.07 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.44 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.44 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  28.78 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.27 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  34.71 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  30.53 
 
 		 187 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  28.83 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  28.15 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  32.35 
 
 		 609 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  32.35 
 
 		 609 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30 
 
 		 374 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  36.21 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  31.85 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.38 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  34.51 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  35.65 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  29.19 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  28.32 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  27.33 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.88 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  40.57 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1903  restriction endonuclease  32.46 
 
 		 640 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  hitchhiker  0.0000000420934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  34 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  22.48 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  29.35 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 196 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  28.45 
 
 		 454 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>