88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4639 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  47.96 
 
 
291 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  49.64 
 
 
454 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  46.76 
 
 
296 aa  225  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  50 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  48.12 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  44.84 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  44.48 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  35.69 
 
 
299 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.36 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  28.94 
 
 
305 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  28.06 
 
 
302 aa  102  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  29.25 
 
 
312 aa  99.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.52 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  29.45 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.23 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  28.29 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  28.03 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  29.41 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.22 
 
 
305 aa  92.4  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  29.22 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  38.19 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  27.91 
 
 
296 aa  90.1  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.56 
 
 
306 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.21 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  27.57 
 
 
302 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  27.5 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  27.5 
 
 
310 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  24.3 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  27.1 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  35.21 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  28.02 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  37.88 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  26.25 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  26.25 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  36.21 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  24.62 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  25.66 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  24.62 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  26.11 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  24.62 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  23.64 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  25.48 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.34 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  26.54 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  32.52 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  35.43 
 
 
368 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  38.28 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  26.95 
 
 
301 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  31.06 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.61 
 
 
421 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30.08 
 
 
326 aa  58.9  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  41.38 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  35.38 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.68 
 
 
440 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  30 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  29.68 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.36 
 
 
222 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  37.27 
 
 
219 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.58 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.38 
 
 
493 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.61 
 
 
328 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  31.25 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  32.59 
 
 
450 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  33.61 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  26.43 
 
 
208 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.91 
 
 
333 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  23.94 
 
 
363 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.52 
 
 
184 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  32.26 
 
 
128 aa  49.3  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  31.45 
 
 
237 aa  49.3  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  36.11 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  31.25 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  29.73 
 
 
585 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  25.17 
 
 
447 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  32.33 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.31 
 
 
271 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  29.77 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  26.17 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.04 
 
 
799 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  27.13 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.04 
 
 
799 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  27.74 
 
 
454 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  28.91 
 
 
454 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.1 
 
 
355 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  26.09 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  29.1 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  26.88 
 
 
200 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>