78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6871 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  45.9 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  46.72 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  44.07 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  43.36 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  43.86 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 520 aa  87.8  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  39.47 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  39.47 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  39.47 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  48.72 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  42.86 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  38.68 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  36.94 
 
 		 178 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  41.58 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  41.58 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  38.1 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  36.54 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  38.61 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  36.54 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.91 
 
 		 421 aa  62  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  33.66 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  40.38 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  27.4 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  32.81 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  39.29 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  39.22 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.94 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30.53 
 
 		 349 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  34.25 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  29.63 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  33.61 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  29.63 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  29.63 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.06 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  31.61 
 
 		 313 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  34.21 
 
 		 289 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 312 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 346 aa  51.6  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  36.44 
 
 		 453 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 317 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  36.52 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  36.19 
 
 		 454 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  36.44 
 
 		 455 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  35.24 
 
 		 454 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  35.24 
 
 		 454 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  26.95 
 
 		 1131 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  29.61 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  36.19 
 
 		 454 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.96 
 
 		 326 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.28 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  32.71 
 
 		 359 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  28.93 
 
 		 1248 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  25.79 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  25.79 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  28.12 
 
 		 1149 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1308  hypothetical protein  25.89 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 374 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  32.2 
 
 		 368 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  35.05 
 
 		 1148 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 363 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 493 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  31.96 
 
 		 328 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1146 aa  42  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  23.85 
 
 		 1291 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.23 
 
 		 306 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>