42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3360 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  100 
 
 		 330 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  93.73 
 
 		 271 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  75.45 
 
 		 342 aa  524  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  61.79 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  43.98 
 
 		 333 aa  261  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  38.62 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  31.64 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  29.91 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  27.09 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  28.4 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  29.71 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  28.82 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  30.28 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  27.01 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.33 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  33.13 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  34.59 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28 
 
 		 853 aa  65.9  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  25 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  35.19 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  27.84 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  22.7 
 
 		 161 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  27.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5319  hypothetical protein  26.78 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  31.68 
 
 		 189 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  29.29 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5176  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.132232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 200 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  26.85 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  32.41 
 
 		 450 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 		 729 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  32.91 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.09 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  21.25 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  27.63 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  24 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.45 
 
 		 732 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  27.32 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  23.68 
 
 		 184 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  23.08 
 
 		 171 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>