26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2103 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  55.82 
 
 		 320 aa  298  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  48.39 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  32.32 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  32.32 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  32.32 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  32.32 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  27.97 
 
 		 400 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.36 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  26.85 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  22.76 
 
 		 384 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 342 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  20.86 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  29.89 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  26.4 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  25.23 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  26.28 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  25.53 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.65 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  25.81 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  29.67 
 
 		 314 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  38 
 
 		 1131 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>