53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2603 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  100 
 
 
342 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  75.45 
 
 
330 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  77.12 
 
 
271 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  58.02 
 
 
363 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  41.39 
 
 
333 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  39.4 
 
 
328 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  30.45 
 
 
341 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30.51 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  26.72 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  25.6 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  27.06 
 
 
346 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  26.82 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  25.71 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  27.21 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  32.69 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  23.55 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.25 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  26.25 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  27.64 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  27.22 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  28.48 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  35.56 
 
 
145 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  32.67 
 
 
189 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  32.29 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.17 
 
 
305 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  30.61 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.7 
 
 
493 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  29.52 
 
 
200 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.96 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5319  hypothetical protein  31.31 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  26.22 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 
732 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  30 
 
 
286 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5176  hypothetical protein  24.24 
 
 
251 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.132232  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  26.09 
 
 
248 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  20.5 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  31.78 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30.36 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.23 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  30.5 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  29.19 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  24.47 
 
 
182 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  28.43 
 
 
222 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  23.08 
 
 
171 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  27.88 
 
 
154 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  25.58 
 
 
853 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  27.05 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  28.89 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  25.64 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  22.22 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  25.64 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  27.97 
 
 
349 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  27.88 
 
 
154 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>