86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12548 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  100 
 
 		 306 aa  613  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  64.71 
 
 		 306 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  43 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  42.67 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  39.94 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  39.34 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  39.09 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  43.28 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  38.91 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  38.59 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  40.72 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  42.02 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  42.16 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  41.31 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  37.66 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  39.74 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  41.61 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  41.61 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  36.93 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  39.41 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  37.79 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  35.92 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  34.75 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30.67 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  35.14 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  36.42 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  36.42 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  36.42 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  36.99 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  33.97 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  29.74 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  31.83 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  45.69 
 
 		 128 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.46 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  25.68 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  25.68 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  25.96 
 
 		 454 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  30.04 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  25.18 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  34.45 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  34.45 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  26.3 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  29.89 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  40.28 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  33.73 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  34.03 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  36.75 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  36.67 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  26.28 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.08 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.66 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  34 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  33.79 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  34 
 
 		 154 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.22 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  34 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  35.29 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  27.95 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  31.45 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  32.06 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.54 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  37.17 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 374 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.09 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 585 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.79 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  31.01 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  26.72 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  32.54 
 
 		 454 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  31.45 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  31.36 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  31.75 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  29.9 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  32.31 
 
 		 70 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  27.87 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  35.11 
 
 		 799 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.73 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  35.11 
 
 		 799 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>