78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1408 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  47.88 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  48.21 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  46.41 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  44.97 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  42.33 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  43.09 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  44.16 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  43 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  40.86 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  41.31 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  41.06 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  43.56 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  43.56 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  37.62 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  40.26 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  40.26 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  36.07 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  34.75 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  35.97 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.54 
 
 		 306 aa  195  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  38.87 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  33.99 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  34.31 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  35.26 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  32.59 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  32.27 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  30 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  30 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  48.03 
 
 		 128 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  33.21 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  29.79 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  27.21 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  30.14 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  27.78 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  27.67 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  25 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  33.78 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  26.45 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.1 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  28.44 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  25.34 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  32.93 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  35.06 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  31.19 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  31.19 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  31.67 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  27.22 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  39.22 
 
 		 585 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  32.65 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  26.75 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  32.77 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.93 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.93 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.93 
 
 		 125 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.87 
 
 		 421 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.93 
 
 		 154 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  29.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5336  hypothetical protein  29.75 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.975729  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.7 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  36.62 
 
 		 70 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.02 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  30.58 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  26.4 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  24.11 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>