23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1552 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  43.68 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  43.77 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  41.09 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  40.57 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  48.31 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  38.73 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.85 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  29.62 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  28.08 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  31.05 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.66 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  26.65 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  26.96 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.82 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  34.73 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  35.57 
 
 		 853 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.88 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  27.56 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  29.8 
 
 		 696 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  32.53 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>