24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0825 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  48 
 
 		 341 aa  271  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  46.36 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  48.31 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  42.77 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  37.84 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  35.67 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.14 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  29.29 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  28.43 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.24 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  25.47 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  27.21 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.52 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  37.96 
 
 		 853 aa  72.4  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  30.73 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  38.37 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  30.34 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  32.41 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0519  hypothetical protein  26.55 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  25.83 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  31 
 
 		 851 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>