33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  93.73 
 
 		 330 aa  513  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  77.12 
 
 		 342 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  63.74 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  46.35 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  40.07 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  28.27 
 
 		 341 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.02 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 351 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  29.18 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  29.5 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  31.05 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  29.29 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  32.53 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  27.46 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  25.72 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  30.97 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.6 
 
 		 853 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  24.36 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  33.33 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  27.78 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  31.68 
 
 		 189 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.96 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  31.48 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  29.59 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  32.22 
 
 		 145 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  32.5 
 
 		 161 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5176  hypothetical protein  23.48 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.132232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  35.59 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  25.53 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  20 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>