25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0004 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  100 
 
 
346 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  56.7 
 
 
351 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  43.02 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  43.77 
 
 
347 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  46.36 
 
 
301 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  34.5 
 
 
346 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  31.7 
 
 
351 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.75 
 
 
333 aa  155  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  29.5 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.15 
 
 
363 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  27.19 
 
 
328 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.25 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  25.6 
 
 
342 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  29.79 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  32.62 
 
 
161 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  25.88 
 
 
333 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  36.73 
 
 
853 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.85 
 
 
301 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  25.91 
 
 
300 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.59 
 
 
805 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  26 
 
 
145 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  30.4 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.46 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  23.46 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>