32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  711    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  55.33 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  36.6 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  39.6 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  35.67 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  31.7 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  29.57 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  28.15 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.96 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.9 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.82 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  26.7 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.97 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  26.59 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  27.21 
 
 		 271 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  28.8 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.62 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  26.43 
 
 		 161 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.19 
 
 		 853 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.81 
 
 		 822 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0519  hypothetical protein  25.22 
 
 		 124 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  27.54 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.19 
 
 		 805 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  27.59 
 
 		 862 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  33 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 683 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  37 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30.09 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  30.56 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>