37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4815 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  100 
 
 
363 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  61.86 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  58.02 
 
 
342 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  63.74 
 
 
271 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  46.71 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  37.95 
 
 
328 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30.86 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  28.82 
 
 
341 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  27.03 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  27.35 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  27.04 
 
 
346 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  28.24 
 
 
301 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  26.65 
 
 
347 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  25.64 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  23.49 
 
 
345 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  35.93 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  36.13 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  25.6 
 
 
853 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5319  hypothetical protein  24.35 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  25.24 
 
 
493 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  32.29 
 
 
320 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.69 
 
 
296 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  24.84 
 
 
520 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  25.17 
 
 
161 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.17 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  28.87 
 
 
145 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.97 
 
 
805 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  30.69 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.68 
 
 
154 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
732 aa  46.2  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.68 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.68 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  31.45 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  27.45 
 
 
222 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  28.26 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  28.57 
 
 
200 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  25.81 
 
 
248 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>