75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1631 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  100 
 
 		 345 aa  707    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  36.5 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  43.53 
 
 		 853 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  27.67 
 
 		 328 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  27.36 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.15 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  27.84 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  25.95 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  28.48 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  28.66 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  29.11 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  25.8 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  35.86 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  23.49 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  23.51 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  27.78 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  31.01 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  30.37 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  25.73 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.26 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.16 
 
 		 154 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  34.19 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  27.21 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.16 
 
 		 125 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.16 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.16 
 
 		 154 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  33.02 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  33.08 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  25.68 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  25 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  42.67 
 
 		 447 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  38.36 
 
 		 421 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  24.54 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  25 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  31.85 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  28.08 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  31.01 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  28.08 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.37 
 
 		 683 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  24.04 
 
 		 805 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  23.6 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  28.66 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.84 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  31.06 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.88 
 
 		 732 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  27.71 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.83 
 
 		 822 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 585 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  27.59 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  29.58 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  27.5 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  27.59 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  37.78 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  26.17 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  29.73 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30.23 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  25.76 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  29.91 
 
 		 700 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  26.99 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  26.99 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  26.99 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>