99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1674 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  100 
 
 		 345 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  61.99 
 
 		 349 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  39.75 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  42.75 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  39.01 
 
 		 493 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  40.6 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  34.56 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  33.77 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  33.77 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  34.55 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  37.88 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.36 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  33.77 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  36.13 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  35.92 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.46 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  35.21 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  37.12 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  32.32 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  35.21 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  31.33 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.67 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  28.82 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  35.4 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  34.86 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  31.18 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  29.66 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  30.63 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  31.85 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.57 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.56 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  31.33 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.31 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  37.86 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  31.82 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  30 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  31.82 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  28.47 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  36.43 
 
 		 196 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  31.34 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1768  hypothetical protein  35.62 
 
 		 584 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.530857  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.29 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  30.15 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  31.03 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  30.15 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  32.43 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  32.43 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  30.15 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  27.15 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  28.93 
 
 		 207 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  30 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  24.35 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.13 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  30.58 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  28.99 
 
 		 450 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  39.74 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  31.2 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  28.77 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  26.55 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  28.99 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  40.51 
 
 		 664 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  26.4 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  29.77 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  26.77 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5054  hypothetical protein  34.21 
 
 		 146 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  31.34 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1635  hypothetical protein  31.73 
 
 		 643 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  28.57 
 
 		 128 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 144 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  25.6 
 
 		 454 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  26.56 
 
 		 454 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  36.49 
 
 		 320 aa  46.2  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  36.05 
 
 		 208 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 152 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.17 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2225  hypothetical protein  32.05 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00433627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2313  hypothetical protein  32.05 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  27.14 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  27.82 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  32.99 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  24 
 
 		 453 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 196 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 250 aa  42.7  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 196 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>