91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0477 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  54.28 
 
 
305 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  53.72 
 
 
302 aa  345  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  53.14 
 
 
304 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  55.45 
 
 
310 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  55.13 
 
 
310 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  52.79 
 
 
305 aa  333  3e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  52.27 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  53.62 
 
 
297 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  54.1 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  52.15 
 
 
303 aa  316  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  53.27 
 
 
306 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  47.56 
 
 
304 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  48.99 
 
 
293 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  45.02 
 
 
310 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  42.77 
 
 
312 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  41.04 
 
 
307 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  45.25 
 
 
305 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  45.25 
 
 
305 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  41.5 
 
 
306 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  39.94 
 
 
306 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  41.06 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  44.09 
 
 
311 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  40.72 
 
 
304 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  38.76 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  42.09 
 
 
304 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  42.09 
 
 
304 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  41.77 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  40.13 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  35.28 
 
 
296 aa  175  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  27.69 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  50 
 
 
128 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  27.18 
 
 
297 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.97 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  29.08 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  27.84 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  28.67 
 
 
454 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  28.62 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  27.6 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  28.16 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  26.62 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  32.75 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.12 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.94 
 
 
493 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  34.91 
 
 
609 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  34.91 
 
 
609 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.44 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  31.85 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  32.64 
 
 
493 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  32.24 
 
 
349 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.85 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  31.58 
 
 
421 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  32.31 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.83 
 
 
454 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  30 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.83 
 
 
454 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 
125 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  40.82 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  26.41 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 
154 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.21 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 
154 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  30 
 
 
454 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.06 
 
 
454 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.6 
 
 
326 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  33.65 
 
 
184 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  30.25 
 
 
455 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  25.13 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.7 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.71 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  26.83 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  20.5 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  29.46 
 
 
374 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  28.57 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  27.33 
 
 
901 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  34.78 
 
 
169 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.91 
 
 
440 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  27.33 
 
 
917 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  31.3 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  26.52 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30.17 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  30 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  30.43 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  29.55 
 
 
585 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  31.67 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  20.89 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  35.44 
 
 
664 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  20 
 
 
271 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  28.32 
 
 
182 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  29 
 
 
359 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>