83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1858 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  100 
 
 		 349 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  61.99 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  41.15 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  38.85 
 
 		 493 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  43.75 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.03 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  38.19 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  35.06 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  33.77 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  34.03 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  38.17 
 
 		 454 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1768  hypothetical protein  26.84 
 
 		 584 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.530857  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.85 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  31.85 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.61 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  30.92 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  28.99 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  29.14 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  38.17 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  32.24 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  33.59 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  33.08 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  33.1 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  29.94 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  31.34 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  29.89 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  29.89 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  35.11 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  31.17 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  30.67 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  32.58 
 
 		 125 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  29.24 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.25 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  31.54 
 
 		 447 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  32.58 
 
 		 154 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  32.58 
 
 		 154 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.2 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  32.58 
 
 		 154 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.36 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  30.41 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  21.99 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.56 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30.07 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5336  hypothetical protein  32.35 
 
 		 450 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.975729  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  29.5 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.87 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  28.32 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 310 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  31.25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  30.3 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  29.1 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.1 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  25.32 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  28.03 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  32.5 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  26.87 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  25.58 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4159  hypothetical protein  24.24 
 
 		 753 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.584256  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  38.37 
 
 		 664 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  27.13 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  27.73 
 
 		 128 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 799 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 799 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  34.69 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  29.23 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  26.36 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.63 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  27.13 
 
 		 454 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  26.36 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>