75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7869 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  45.74 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  50.83 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  42.98 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  44.25 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.23 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.44 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 799 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 799 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  33.06 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  33.04 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  43 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  27.42 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5134  restriction endonuclease  28.49 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360848  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  37.17 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  32.81 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  37.17 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  33.58 
 
 		 447 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  29.57 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  31.71 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3506  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.81 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  28.91 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  30.84 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  28.07 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.92 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  33.15 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  33.15 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  29.69 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  38.3 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.91 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  34.69 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  28.07 
 
 		 440 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 327 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.04 
 
 		 585 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  32.69 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  32.38 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  27.82 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  29.31 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  36.19 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.57 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  28.03 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  35.05 
 
 		 454 aa  46.2  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  33.87 
 
 		 281 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  28.44 
 
 		 299 aa  45.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30 
 
 		 450 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  31.08 
 
 		 1291 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  30.67 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 374 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  34.25 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  25.22 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  23.28 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 453 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  28.46 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  32.46 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  27.5 
 
 		 386 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>