41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1653 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  81.21 
 
 
197 aa  264  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  67.8 
 
 
233 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  67.8 
 
 
233 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  67.43 
 
 
233 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  38.69 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  36.52 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  36.61 
 
 
289 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  34.78 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  35.65 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  35.71 
 
 
289 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  41.76 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  38.46 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  36.94 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  41.51 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  41.18 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.63 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  41.82 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  41.9 
 
 
260 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.48 
 
 
359 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  41.24 
 
 
249 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  39.66 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  42.2 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  34.26 
 
 
271 aa  52  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  34.34 
 
 
201 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.65 
 
 
368 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  26.88 
 
 
305 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  24.2 
 
 
252 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35.24 
 
 
285 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  37.5 
 
 
250 aa  44.3  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  33.33 
 
 
453 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  29.75 
 
 
262 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  28.95 
 
 
230 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  26.37 
 
 
328 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  29.49 
 
 
345 aa  41.2  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  27.84 
 
 
152 aa  41.2  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  28.16 
 
 
364 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  28.12 
 
 
144 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  22.45 
 
 
327 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>